Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms