Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krt90E9Q1Z0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms