Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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