Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9972E9Q053 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms