Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ryr1E9PZQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ryr1E9PZQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms