Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd2E9PZM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd2E9PZM4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms