Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setd1aE9PYH6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Setd1aE9PYH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Setd1aE9PYH6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms