Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn4E9PX29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn4E9PX29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms