Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc17E9PVB5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc17E9PVB5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms