Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3bE9PUL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3bE9PUL3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms