Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cngb1E1AZ71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cngb1E1AZ71 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cngb1E1AZ71 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms