Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930444G20RikD3Z741 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444G20RikD3Z741 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444G20RikD3Z741 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms