Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lce6aD3YV94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lce6aD3YV94 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lce6aD3YV94 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lce6aD3YV94 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lce6aD3YV94 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms