Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700015F17RikD3YUK8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700015F17RikD3YUK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms