Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmf1B9EKI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmf1B9EKI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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