Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700006A11RikB9EHI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700006A11RikB9EHI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
1700006A11RikB9EHI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms