Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia4B8QI36 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms