Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20547B8JJN0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gm20547B8JJN0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm20547B8JJN0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20547B8JJN0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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