Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syce3B5KM66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce3B5KM66 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce3B5KM66 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms