Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6133B2RY53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6133B2RY53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms