Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr3aB2RXC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr3aB2RXC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms