Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc11B2RXC1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc11B2RXC1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms