Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cspp1B2RX88 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cspp1B2RX88 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms