Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah3B2RWG3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Siah3B2RWG3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah3B2RWG3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms