Protein–RNA interactions for Protein: B2RW88

Prr19, Proline-rich 19, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr19B2RW88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prr19B2RW88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Prr19B2RW88 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Prr19B2RW88 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Prr19B2RW88 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prr19B2RW88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr19B2RW88 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms