Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clrn2B2RVW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clrn2B2RVW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clrn2B2RVW2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms