Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms