Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms