Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf518bB2RRE4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms