Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms