Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm438B1ASB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm438B1ASB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms