Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik3B1AS29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik3B1AS29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms