Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slfn8B1ARD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slfn8B1ARD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms