Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skint7A7XV04 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skint7A7XV04 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint7A7XV04 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms