Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skint5A7XUY5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint5A7XUY5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint5A7XUY5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms