Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M5A7VMS3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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