Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skor2A7M7C7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Skor2A7M7C7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skor2A7M7C7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms