Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Herc3A6H6S0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms