Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp8b5A3FIN4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b5A3FIN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms