Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Btbd35f28A2CFD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Btbd35f28A2CFD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms