Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samt1A2BED8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms