Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtf1A2AQ19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtf1A2AQ19 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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