Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam205aA2APU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam205aA2APU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam205aA2APU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms