Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec16aA2AIX1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sec16aA2AIX1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms