Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34dA2AGU5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms