Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms