Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd4A2AFR3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd4A2AFR3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms