Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms