Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb4A2A863 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb4A2A863 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb4A2A863 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms