Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm2A2A7B5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm2A2A7B5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms