Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdr2lA2A6T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr2lA2A6T1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms